分类系统 (Taxonomy)

v1.1 (schema)
· 53 个枚举类型 · 来自taxonomy/versions/v1.yaml + migration 005

sex_enum

3
M·
F·
unknown·未知

sex_enum

2
M·
F·

em_status

6
absent_not_done·未做
pending·待定
completed·已完成
completed_no_glom·完成(无肾小球)
completed_uninformative·完成(无诊断价值)
completed_all_sclerotic·完成(全部硬化)

em_status

1
unavailable·EM 不可评 (无可用电镜)

severity_level

7
none·
minimal·极轻(<5%)
mild·轻度
moderate·中度
marked·显著
severe·重度
present_ungraded·有(未分级)

distribution_level

6
absent·
focal·局灶
segmental·节段
near_50pct·近半数
diffuse·弥漫
present·有(未分级)

congo_red_result

3
negative·阴性
positive·阳性
not_done·未做

if_panel

3
frozen_IF·冰冻 IF
paraffin_IF·石蜡 IF
immunoenzyme·免疫酶

if_marker_name

26
IgG·IgG
IgA·IgA
IgM·IgM
IgG1·IgG1
IgG2·IgG2
IgG3·IgG3
IgG4·IgG4
C3·C3
C4·C4
C1q·C1q
kappa·κ
lambda·λ
PLA2R1·PLA2R1
THSD7A·THSD7A
Nell_1·Nell-1
Km55·Km55
H_factor·H factor
SAA·SAA
albumin·白蛋白
fibrinogen·纤维蛋白原
EXT2·EXT2
collagen_IV_a2·IV 型胶原 α2
collagen_IV_a5·IV 型胶原 α5
ATTR·ATTR
DNAJB9·DNAJB9
C4d·C4d

marker_category

3
routine·常规
special_stain·特殊染色
special_ihc·特殊免疫组化

if_intensity

13
negative·阴性
equivocal_plus_minus·± 可疑
trace·微量
one_plus·+
two_plus·++
three_plus·+++
four_plus·++++
intermediate_1_to_2·+~++
intermediate_2_to_3·++~+++
intermediate_3_to_4·+++~++++
positive_unspecified·阳性(未分级)
negative_grouped·均阴性
unevaluable_no_glom·无肾小球不可评

if_evaluability

5
evaluable·可评
no_glomerulus·IF无肾小球
grouped_statement·成组阴性陈述
panel_not_performed·未做该组
no_tissue_sampled·无组织取样

if_location

9
mesangium·系膜区
GBM·基底膜 GBM
subepithelial·上皮下
subendothelial·内皮下
tubular_BM·肾小管 BM
PTC·管周毛细血管
vascular_wall·血管壁
interstitial_cells·间质细胞
tubular_epithelium·肾小管上皮细胞胞浆

if_location

8
mesangium·系膜区
GBM_or_subepithelial·基底膜/上皮下(含毛细血管壁)
subendothelial·内皮下
tubular_BM·肾小管 BM
PTC·管周毛细血管
vascular_wall·血管壁
interstitial_cells·间质细胞
tubular_epithelium·肾小管上皮细胞胞浆

distribution_level

3
diffuse·弥漫
present·有(非弥漫)
absent·

if_pattern

4
granular·颗粒状
linear·线性
lumpy·团块状
clumped·凝集状

fpe_level

7
none·
minimal·少部分
partial·部分
extensive·大部分
most·大多数
diffuse_fpe·弥漫
complete·完全

gbm_irregularity

3
smooth·规则
segmental_irregular·节段不规则
diffuse_marked·弥漫(显著不规则)

gbm_extent_grade

6
none·
individual·个别
segmental·节段
partial·部分
most·大部分
diffuse·弥漫

capillary_loop_patency_enum

4
good·
fair·尚可
poor·欠佳
very_poor·

gbm_qualifier_enum

12
segmental_tear·节段撕裂
segmental_thinning·节段变薄
segmental_lamination·节段分层
lamina_rara_interna_widening·内疏松层增宽
basket_weave·篮状编织
pseudo_double_contour·假双轨
true_double_contour·真双轨
wrinkling·褶皱
eyelash_appearance·睫毛状
finger_spicules·指突状
rigid·僵硬
pseudotumoral_formation·假瘤样形成

em_deposit_location

7
subepithelial·上皮侧(上皮下)
subendothelial·内皮下
mesangial·系膜区
intramembranous·GBM 内
tubular_BM·TBM
PTC·管周毛细血管 PTC
other·其他

em_deposit_density

5
sparse·稀疏
sparse_to_moderate·稀疏~中等
few·少量
moderate·中等
abundant·丰富

em_deposit_amount

5
occasional·偶见
trace·微量
few·少量
moderate·中等量
abundant·大量

em_deposit_morphology

3
granular·颗粒状
lumpy·团块状
band_like·带状

em_deposit_absorption

6
none·
intact·完整
partial_absorption·部分
most·大部分
diffuse·弥漫
full_absorption·完全吸收

diagnosis_source

2
LM·光镜
EM·电镜

disease_category

33
MN·膜性肾病
IgAN·IgA 肾病
FSGS·局灶节段性
MCD·微小病变
LN·狼疮肾炎
DN·糖尿病肾病
ANCA_GN·ANCA 相关 GN
anti_GBM·抗 GBM 病
TMA·血栓性微血管病
AIN·急性间质性肾炎
amyloidosis·淀粉样变
MPGN·膜增生性
C3GN·C3 肾病
fibrillary·纤维样肾病
hypertensive_nephrosclerosis·高血压性肾硬化
IgG4_related_disease·IgG4 相关疾病
interstitial_nephritis·间质性肾炎(legacy)
other·其他
PGNMID·PGNMID
obesity_related·肥胖相关
ischemic·缺血性
minor_abnormalities·轻微异常
thin_basement_membrane·薄基底膜
drug_related_TMA·药物相关 TMA
ATN·急性肾小管坏死
oligomeganephronia·先天肾单位减少
hypertensive_arteriolosclerosis·肾小动脉硬化
hypertensive_nephropathy·高血压肾病
malignant_hypertension_nephropathy·恶性高血压肾损害
tubulointerstitial_disease·肾小管间质病变
midd·单克隆免疫球蛋白沉积病
cast_nephropathy·管型肾病
alport_syndrome·Alport 综合征

diagnosis_certainty

8
definite·确诊
consistent_with·符合
clinical_correlation_pending·待临床相关
descriptive_only·描述性
strong_clinical_correlation·强临床相关
possible·可能
cannot_exclude·不除外
advisory_only·咨询性

mn_stage

5
I·I 期
II·II 期
III·III 期
IV·IV 期
not_assessed·未评

chronicity_modifier_enum

2
trending_chronic·趋于慢性
acute_on_chronic·慢性基础上急性

crescent_subtype_enum

3
cellular·细胞性
fibrocellular·细胞纤维性
fibrous·纤维性

isn_rps_class_enum

7
I·I 类
II·II 类
III·III 类
IV_S·IV-S 类(节段性)
IV_G·IV-G 类(球性)
V·V 类
VI·VI 类

isn_rps_modifier

4
A·A
C·C
A_over_C·A/C
none·

clinical_diagnosis_category

4
syndrome·综合征
comorbidity·共病
symptom·症状
history·病史

lab_comparator

4
equals·等于
greater_than·大于
less_than·小于
approximate·约等

lab_interpretation

8
positive·阳性
negative·阴性
elevated·升高
reduced·降低
equivocal·可疑
unspecified·未定
overweight·超重
obese·肥胖

issue_severity

2
warning·警告
error·错误

issue_code

9
low_confidence·低置信度
schema_violation·架构违反
out_of_range·超出范围
missing_required·必填缺失
unmapped_phrase·未映射短语
marker_not_in_taxonomy·标志物未分类
lab_interpretation_unresolved·化验解读未决
semantic_rule_violated·语义规则违反
backfill_v1_1·v1.1 回填

run_kind

8
pilot·pilot
bootstrap_discovery·bootstrap_discovery
pilot_preview·pilot_preview
full·full
qc_sample·qc_sample
reextract_full·reextract_full
reextract_fast·reextract_fast
reingest·reingest

run_triggered_by

4
manual·手动
reingest·重摄取
taxonomy_bump·分类升级
scheduled·定时

run_status

4
running·运行中
succeeded·成功
partial·部分
failed·失败

shadow_priority

3
low·
normal·正常
high·

shadow_resolved_as

3
accepted·采纳
rejected·驳回
merged_partial·部分合并

pii_source_field

3
header·头部
filename·文件名
narrative_accidental·正文意外

oxford_mest

3
0·0
1·1
2·2

oxford_mest

3
0·0
1·1
__unscored__·未评(未评分)

oxford_mest

4
0·0
1·1
2·2
__unscored__·未评(未评分)

cast_type_enum

9
rbc·红细胞管型
protein·蛋白管型
hemoglobin·血红蛋白管型
myoglobin·肌红蛋白管型
foreign_body_giant_cell·异物巨细胞管型
inflammatory·炎细胞管型
thyroglobulin_like·甲状腺球蛋白样管型
bile_acid·胆汁酸管型
other·其他管型

cast_amount_enum

6
abundant·大量
many·较多
partial·部分
few·少量
present·
absent·

vessel_type_enum

7
interlobular_artery·小叶间动脉
afferent_arteriole·入球小动脉
efferent_arteriole·出球小动脉
arcuate_artery·弓形动脉
artery·动脉
arteriole·小动脉
other·其他

vessel_lesion_enum

17
wall_thickening·管壁增厚
intimal_thickening·内膜增厚
wall_fibrosis·壁纤维化
wall_sclerosis·壁硬化
luminal_stenosis·管腔狭窄
luminal_occlusion·管腔闭塞
wall_necrosis·壁坏死
hyaline_degeneration·透明变性
hyalinosis·玻璃样变
onion_skin·葱皮样改变
subendothelial_widening·内皮下疏松
subendothelial_mucoid·内皮下粘液样变
subendothelial_fibrinoid·内皮下纤维素渗出
thrombus·血栓
afferent_arteriolar_hyalinosis·入球小动脉透明变性
efferent_arteriolar_hyalinosis·出球小动脉透明变性
other·其他

transplant_dx_enum

9
TCMR·TCMR
AMR·AMR
borderline·临界改变
chronic_changes·慢性改变
polyomavirus_nephropathy·多瘤病毒肾病
recurrent_or_de_novo_gn·复发/新发肾小球病
TMA·TMA
transplant_pyelonephritis·移植相关肾盂肾炎
other·其他

Schema 同步状态

此页显示的枚举值来自 UI 端 schema.ts,应与 Postgres 的 pg_enum 保持一致。漂移由 pipeline/sync_taxonomy.py --check 在每次抽取前校验(尚未实现,列入 v3 任务清单)。